В таком слове ударения следует ставить на слог с первой буквой А и на слог с буквой И — штАб-квартИры.
Иногда кучка домиков была достаточно велика, чтобы обзавестись таверной или даже гостиницей, в которых Дугал устраивал себе нечто вроде шта́б-кварти́ры на целый день.
— Диана Гэблдон, Чужестранка
Пьяный капитан Ваймс медленно, запинаясь на каждом шагу, прошел по улице и осторожно рухнул в сточную канаву неподалеку от шта́б-кварти́ры Ночной Стражи.
— Терри Пратчетт, Стража! Стража!
Со своего наблюдательного пункта, расположенного на крыше шта́б-кварти́ры стражи, капитан Ваймс хорошо видел высыпавших на университетские крыши волшебников.
— Терри Пратчетт, Стража! Стража!
– В чем дело, Доб, дружище? – спросил полковник, предположив, что в лагере пожар или что из шта́б-кварти́ры полка пришел приказ о выступлении.
— Уильям Теккерей, Ярмарка тщеславия
Днем, после того как каждому из нас сделали по несколько уколов, пришла машина и отвезла нас в центральный полицейский участок, нечто вроде шта́б-кварти́ры.
— Анри Шарьер, Папийон