В таком слове ударения должны быть поставлены на слог с буквой И и на слог с последней буквой О — сИнхрофазотрОна.
В основу си́нхрофазотро́на заложен принцип ускорения заряженных частиц магнитным полем!
— Сергей Александрович Краюхин, БОНМО, 2015
Я состряпал улыбку трёхлетнего малыша, которому рассказали об устройстве си́нхрофазотро́на.
— Андрей Евдокимов, Запах псины, 2009
Он легко к месту и не к месту цитировал классиков российской словесности, мог поддержать умный разговор о роли си́нхрофазотро́на в современной науке, уверенно спорил о возрасте египетских пирамид и чётко знал химическую формулу спирта.
— Константин Скуратов, Как посмотреть, 2015
Сам он представлял себя специалистом во всех мыслимых областях, от запуска си́нхрофазотро́на до зашептывания больного зуба в лунную ночь.
— Лора Ванхорн, Выход зубной феи, 2016
– Почему? Ты зайди, чего стесняешься? Ты и си́нхрофазотро́на какого-нибудь будешь стесняться?
— Михаил Савеличев, Крик родившихся завтра, 2016