В указанном выше слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой Е — обмелЕнию.
Так, например, непропорциональный забор воды из мелководных рек и озёр может привести к их обмеле́нию.
— Д. О. Сиваков, Водное право России и зарубежных государств, 2010
Всепланетная засуха приведёт к огромным лесным пожарам, а также обмеле́нию части рек.
— И. С. Прокопенко, Великие тайны великих людей, 2015
Если вы не собираетесь спускать водоём на зиму, то грунтовые воды, также замерзнув зимой (а вода при замерзании расширяется), будут выпирать и выдавливать дно пруда, приводя к его обмеле́нию.
— Анна Зорина, Строительство водоемов на участке своими руками, 2016
На смену обмеле́нию моря пришёл угрожающий большими неприятностями процесс затопления и подтопления прибрежных низинных территорий.
— Г. А. Разумов, Атлантиды земли и морей
Так, непропорциональный забор воды из мелководных рек и озёр может привести к их обмеле́нию.
— Д. О. Сиваков, Водное право: Учебно-практическое пособие, 2009