В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой Е — ионосфЕрные.
К 2075 году, когда наконец-то было сформировано мировое правительство, вся инфраструктура, включающая ионосфе́рные станции, исследовательские центры и лаборатории перешли под начало, специально учреждённой для этого, глобальной корпорации «Климат».
— Майк Ронин, Земля, до востребования
Существуют и ионосфе́рные бури.
— А.М. Лушнов, Медицинские информационные системы: многомерный анализ медицинских и экологических данных, 2013
Следовательно, продолжая логическую цепочку – искусственную бурю, могли вызвать искусственные ионосфе́рные установки, передающие возмущение на определённые слои атмосферы с различной магнитудой.
— Алексей Осетров, Лунный свет на заре. Книга первая. Цикл «Ярость Творца»
Причём нанести удар на пределе дальности действия ракет «воздух-земля» им помешали ионосфе́рные помехи, которые резко снижали точность любого «умного» оружия.
— Алексей Доронин, Поколение пепла, 2015
Показано, что ионосфе́рные параметры оказывают влияние на процессы переработки информации мозгом.
— А.М. Лушнов, Медицинские информационные системы: многомерный анализ медицинских и экологических данных, 2013