В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой О — зооспОры.
При бесполом размножении протопласт делится на 4 или 8 частей, образуются зооспо́ры.
— Н. М. Ключникова, Ботаника. Систематика растений: учебное пособие, 2013
Период активного движения непродолжительный; поплавав некоторое время, зооспо́ры теряют жгутики, одеваются оболочкой, растут, достигая размеров, характерных для того или иного вида.
— Н. М. Ключникова, Ботаника. Систематика растений: учебное пособие, 2013
В таком покоящемся состоянии зигота-спорофит находится некоторое время, и затем после редукционного деления в ней формируются зооспо́ры числом 4—16.
— Н. М. Ключникова, Ботаника. Систематика растений: учебное пособие, 2013
При прорастании споры из неё выходят зооспо́ры с двумя жгутиками, или крошечными слизевиками – амёбами.
— Ирина Филиппова, Грибы против рака, 2014