В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с первой буквой И — зондИровали.
Большинство волков, которых я встречал – даже тех, кто приближался ко мне из любопытства, – осторожно зонди́ровали почву, готовые при малейшем подозрительном движении или странном запахе скрыться за горизонтом.
— Ник Дженс, Волк по имени Ромео. Как дикий зверь покорил сердца целого города, 2014
Целые отряды водолазов зонди́ровали дно морское на сотни метров вглубь, но везде находили только вулканический туф, кристаллизовавшийся под давлением воды, гранит и глинистый сланец.
— Александр Беляев, Последний человек из Атлантиды, 1925
Они летели по межгалактической трассе в автоматическом режиме, занимались своей обычной научной работой, отбирали пробы космической пыли и газов, изучали излучение звёзд и зонди́ровали планеты.
— Геннадий Разумов, Старое фото