В данном слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой И — дифтерИйных.
Носители нетоксигенных дифтери́йных палочек допускаются в детские коллективы.
— Анастасия Полянина, Реабилитация после детских инфекционных заболеваний, 2013
Источники инфекции – больной человек или носитель токсигенных штаммов дифтери́йных бактерий.
— Н. В. Гаврилова, Инфекционные заболевания: конспект лекций
Для отличия дифтери́йных плёнок от гнойных лакунарных налётов и пробок можно использовать сухую и водяную пробы.
— Анатолий Нагнибеда, Неотложная синдромология. Скорая медицинская помощь. Практическое руководство, 2009
Особенностью вирусных миокардитов является частое вовлечение в патологический процесс перикарда (миоперикардит), при дифтери́йных миокардитах нередко выявляются серьёзные нарушения проводимости, вплоть до полной атриовентрикулярной блокады.
— Коллектив авторов, Внутренние болезни, 2006