В таком слове ударения должны быть поставлены на слог с первой буквой И и на слог со второй буквой О — гИповитаминОзом.
Состояние, возникшее в результате недостатка какого-либо витамина, называют ги́повитамино́зом, а в результате его полного отсутствия – авитаминозом.
— Е. А. Куренкова, Проращенный овес, 2013
Заболевание, вызванное недостатком в организме того или иного витамина, называется ги́повитамино́зом.
— Иван Дубровин, Большой лечебный травник
Так говорит поэт. Медики же прозаически называют подобное состояние ги́повитамино́зом, т. е. дефицитом витаминов в организме.
— Владислав Леонкин, Сезонные заболевания. Весна
Насколько я знаю, последствия сродни с осенним ги́повитамино́зом – зрение садится, усталость прогрессирует, ногти ломаются…
— Сергей Зверев, Забудь дорогу назад, 2011
Всё это, безусловно, сопровождается ги́повитамино́зом и анемией.
— Коллектив авторов, Знакомьтесь, Ваш кишечник. Можно ли им управлять?, 2018