В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с последней буквой И — гемофилИю.
А вот в медицине, соединяясь, создают весьма страшное понятие – болезнь гемофили́ю.
— Наталья Романова-Сегень, Великая княгиня Елизавета Федоровна. И земная, и небесная, 2018
Вместе со склонностью к мистицизму она унаследовала от своей матери способность передавать наследникам по мужской линии гемофили́ю.
— Всеволод Колесник, Россия на перепутье. Историко-публицистическая трилогия, 2012
Это сам дьявол, он пьяница и развратник, но обладает некой тёмной силой, удачно лечит гемофили́ю наследника и тем вырос в глазах императрицы.
— Николай Максимович Ольков, И ныне, и присно. Собрание сочинений. Том 11
В её голосе было столько омерзения именно к «женщине», которая «передаёт гемофили́ю», как будто это не несвёртываемостъ крови, а цветущий сифилис.
— Александрос Бурджанадзе, Пасынки отца народов. Какого цвета любовь? Квадрология. Книга третья
Возьмём для примера гемофили́ю.
— Джон Браннер, Всем стоять на Занзибаре, 1968